Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms