Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms