Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms