Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A1O14983 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A1O14983 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms