Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
IFIT3O14879 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms