Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIN1O00499 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BIN1O00499 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BIN1O00499 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIN1O00499 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIN1O00499 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIN1O00499 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIN1O00499 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BIN1O00499 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIN1O00499 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIN1O00499 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BIN1O00499 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BIN1O00499 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BIN1O00499 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BIN1O00499 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BIN1O00499 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIN1O00499 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIN1O00499 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIN1O00499 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIN1O00499 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BIN1O00499 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIN1O00499 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BIN1O00499 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIN1O00499 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIN1O00499 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIN1O00499 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIN1O00499 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIN1O00499 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIN1O00499 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIN1O00499 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIN1O00499 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIN1O00499 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIN1O00499 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms