Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
O00370 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
O00370 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
O00370 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
O00370 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
O00370 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
O00370 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
O00370 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
O00370 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
O00370 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
O00370 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
O00370 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
O00370 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
O00370 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
O00370 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
O00370 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
O00370 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
O00370 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms