Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP23O00161 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP23O00161 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms