Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1D1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1D1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1D1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1D1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1D1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1D1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1D1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1D1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H7C1D1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1D1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1D1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1D1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1D1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1D1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H7C1D1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H7C1D1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1D1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1D1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1D1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1D1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1D1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1D1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1D1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H7C1D1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H7C1D1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1D1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1D1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1D1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1D1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1D1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1D1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1D1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H7C1D1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H7C1D1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H7C1D1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H7C1D1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H7C1D1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H7C1D1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H7C1D1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H7C1D1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H7C1D1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H7C1D1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
H7C1D1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms