Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHLA1C9JL84 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HHLA1C9JL84 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms