Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms