Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIS3P2A8K0S8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms