Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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