Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DBX1A6NMT0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DBX1A6NMT0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms