Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms