Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB4A4D0S4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB4A4D0S4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms