Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms