Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YXV3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0J9YXV3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms