Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 SPATA33-201ENST00000301031 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 AC009927.1-201ENST00000510501 1779 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SLC44A3-204ENST00000467909 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GNA13-202ENST00000541118 1502 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GALNT14-203ENST00000406653 2496 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ACO1-202ENST00000379923 3601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 STAT6-204ENST00000538913 2879 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 FLT3-201ENST00000241453 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SPRY2-202ENST00000377104 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC026202.1-201ENST00000443087 585 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 IGHVII-65-1-201ENST00000519992 302 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC023078.7-201ENST00000532712 961 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 C3orf35-205ENST00000426078 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PGAP2-235ENST00000532523 1696 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LINC01070-201ENST00000561786 2829 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC008132.1-201ENST00000419447 2068 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AL050303.4-201ENST00000624520 1839 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CLN8-212ENST00000637083 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC093690.1-201ENST00000418963 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NOP2-203ENST00000399466 2701 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LINC01934-205ENST00000435411 1771 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC092295.2-201ENST00000592087 1392 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MYLPF-201ENST00000322861 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NDUFAF3-201ENST00000326912 705 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 LINC02051-201ENST00000456535 690 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC023194.3-202ENST00000524253 364 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC025031.2-201ENST00000550319 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.59-201ENST00000621376 277 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 CRNN-201ENST00000271835 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 RBMY1F-202ENST00000454978 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 AC018737.2-201ENST00000624478 1512 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 TIRAP-202ENST00000392679 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 PRAMEF27-201ENST00000436041 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LMO3Q8TAP4 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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