Protein–RNA interactions for Protein: Q86UN3

RTN4RL2, Reticulon-4 receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RL2Q86UN3 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AL359317.2-201ENST00000554898 1826 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC012377.1-201ENST00000499797 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 CENPO-206ENST00000473706 4272 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 MRPL45-204ENST00000619548 1554 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 PNMA6F-201ENST00000436629 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 MARCH7-209ENST00000539065 3303 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 NDUFA5-211ENST00000611607 1504 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 APP-201ENST00000346798 3467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 FAM71F1-201ENST00000315184 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 LINC01898-201ENST00000564156 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 COX6B2-205ENST00000588572 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC003991.1-211ENST00000631117 870 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 CD1E-208ENST00000368163 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 TUBD1-205ENST00000394239 1680 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 CHMP3-204ENST00000409727 1851 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 AFF4-203ENST00000378595 3348 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 C1RL-AS1-201ENST00000382215 2086 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RTN4RL2Q86UN3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RTN4RL2Q86UN3 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RTN4RL2Q86UN3 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 GLB1L3-203ENST00000431683 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 2191 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 GDF9-207ENST00000624495 1799 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 TAF1C-218ENST00000567759 3879 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 AC027682.7-201ENST00000623147 2121 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 CENPP-201ENST00000375576 3088 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 ZFP1-203ENST00000464850 3067 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 LINC00664-201ENST00000596203 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 PWP1-201ENST00000412830 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTN4RL2Q86UN3 ZNF2-203ENST00000614034 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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