Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 HSD3B1-204ENST00000528909 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PAX6-258ENST00000639548 1417 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ZNF792-202ENST00000605484 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ZNF442-203ENST00000438182 1906 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TCL6-204ENST00000460130 911 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 HSBP1-204ENST00000570259 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC092120.3-201ENST00000605168 568 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC008897.3-201ENST00000607296 483 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TGM5-201ENST00000220420 2767 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TGM5-205ENST00000610827 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC122129.1-201ENST00000354746 1815 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 NOP2-201ENST00000322166 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A4-201ENST00000357336 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AL138899.1-201ENST00000415019 1999 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 C2orf15-201ENST00000302513 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SERPINA1-203ENST00000393088 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ZNF7-209ENST00000529819 513 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC025580.2-203ENST00000560647 702 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 MIR3183-201ENST00000578566 84 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AP003973.2-201ENST00000604700 499 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 AC010624.1-201ENST00000527209 1525 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO3Q8TAP4 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 UBE2A-211ENST00000631185 1435 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 XPNPEP1-203ENST00000369683 2344 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO3Q8TAP4 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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