Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA3Q9Y6H8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA3Q9Y6H8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJA3Q9Y6H8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms