Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP20Q9Y6A4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP20Q9Y6A4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms