Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPO11Q9Y5K1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPO11Q9Y5K1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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