Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAXBP1Q9Y5B6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAXBP1Q9Y5B6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms