Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB1Q9Y478 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB1Q9Y478 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB1Q9Y478 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB1Q9Y478 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB1Q9Y478 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB1Q9Y478 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRKAB1Q9Y478 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAB1Q9Y478 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB1Q9Y478 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms