Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIK3Q9Y2K2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIK3Q9Y2K2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms