Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS2Q9Y248 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms