Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GNEQ9Y223 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GNEQ9Y223 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GNEQ9Y223 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms