Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVW-1Q9UQF0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVW-1Q9UQF0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms