Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTNND2Q9UQB3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms