Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRQQ9UN88 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRQQ9UN88 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRQQ9UN88 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms