Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNRGQ9UMZ2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms