Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNPO2Q9UMS6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNPO2Q9UMS6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms