Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNRF3Q9ULT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNRF3Q9ULT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNRF3Q9ULT6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms