Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
INO80Q9ULG1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
INO80Q9ULG1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
INO80Q9ULG1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms