Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PARP4Q9UKK3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PARP4Q9UKK3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms