Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CROTQ9UKG9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CROTQ9UKG9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms