Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms