Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHQ1

NARF, Nuclear prelamin A recognition factor, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NARFQ9UHQ1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NARFQ9UHQ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NARFQ9UHQ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms