Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
MLH3Q9UHC1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MLH3Q9UHC1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms