Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFF4Q9UHB7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms