Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms