Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRF1LQ9UGC7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms