Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFDP1Q9UEE9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFDP1Q9UEE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms