Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIP2Q9UDT6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP2Q9UDT6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms