Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK2Q9UBU2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms