Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DKK3Q9UBP4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DKK3Q9UBP4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms