Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAE1Q9UBE0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAE1Q9UBE0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms