Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD2Q9UBB5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms